Эта иерархия позволяет очень просто получать ВСЕ дочерние элементы.
НО получение списка элементов находящихся непосредственно в этой папке довольно проблематично.
Кроме того вставка/удаление одного элемента заставляет изменять правые/левые значения узлов по ВСЕЙ таблице. А если это MyISAM — то кратковременно будет заблокирована вся таблица. Короче решение для редко изменяемых деревьев.
Задачи бывают разные, и для каждой задачи удобнее свои методы построения иерархии.